Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ophn1Q99J31 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ophn1Q99J31 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ophn1Q99J31 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ophn1Q99J31 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ophn1Q99J31 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ophn1Q99J31 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms