Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn16Q925N4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms