Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubb6Q922F4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms