Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klc3Q91W40 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klc3Q91W40 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms