Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgip1Q8VD37 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms