Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Dnajc28Q8VCE1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dnajc28Q8VCE1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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