Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3G9

Tspan8, Tetraspanin-8, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan8Q8R3G9 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tspan8Q8R3G9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms