Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MyripQ8K3I4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms