Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Depp1Q8K2F3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms