Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Polr1eQ8K202 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Polr1eQ8K202 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr1eQ8K202 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms