Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cldn34c1Q8K193 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms