Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms