Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alx1Q8C8B0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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