Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Aph1bQ8C7N7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Aph1bQ8C7N7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Aph1bQ8C7N7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Aph1bQ8C7N7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Aph1bQ8C7N7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Aph1bQ8C7N7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Aph1bQ8C7N7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms