Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ccdc187Q8C5V8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ccdc187Q8C5V8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc187Q8C5V8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc187Q8C5V8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc187Q8C5V8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc187Q8C5V8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc187Q8C5V8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ccdc187Q8C5V8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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