Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc113Q8C5T8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms