Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8C5C9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8C5C9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms