Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg16l1Q8C0J2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg16l1Q8C0J2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atg16l1Q8C0J2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atg16l1Q8C0J2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atg16l1Q8C0J2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Atg16l1Q8C0J2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atg16l1Q8C0J2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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