Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim47Q8C0E3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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