Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cops7bQ8BV13 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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