Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Pggt1bQ8BUY9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pggt1bQ8BUY9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms