Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep55Q8BT07 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms