Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smarcal1Q8BJL0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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