Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms