Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc172Q810N9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms