Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ttc28Q80XJ3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms