Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zbed4Q80WQ9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zbed4Q80WQ9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zbed4Q80WQ9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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