Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SnupnQ80W37 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SnupnQ80W37 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms