Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc29Q80VM3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ttc29Q80VM3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ttc29Q80VM3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc29Q80VM3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms