Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgef17Q80U35 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Arhgef17Q80U35 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgef17Q80U35 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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