Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Dsg1bQ7TSF1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Dsg1bQ7TSF1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Dsg1bQ7TSF1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Dsg1bQ7TSF1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dsg1bQ7TSF1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Dsg1bQ7TSF1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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