Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trappc6aQ78XR0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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