Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sys1Q78S06 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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