Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mindy1Q76LS9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms