Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtifQ6PEE2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtifQ6PEE2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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