Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt87Q6IMF0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt87Q6IMF0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms