Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Q6DFW0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms