Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cntn4Q69Z26 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cntn4Q69Z26 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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