Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pkp4Q68FH0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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