Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnna3Q65CL1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnna3Q65CL1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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