Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc18Q640L5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc18Q640L5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms