Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Col4a5Q63ZW6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Col4a5Q63ZW6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col4a5Q63ZW6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms