Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Polr2kQ63871 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms