Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ss18Q62280 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ss18Q62280 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ss18Q62280 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms