Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rai1Q61818 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rai1Q61818 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rai1Q61818 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rai1Q61818 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rai1Q61818 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rai1Q61818 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms