Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga6Q61739 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms