Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms