Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprnQ60673 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtprnQ60673 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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