Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms