Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Zzef1Q5SSH7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms